Le livre sur les fossiles contient de nombreuses gravures sur bois représentant des roches, des minéraux et des fossiles au sens où on l'entend aujourd'hui. Au XVIe siècle, à quelques exceptions près, les fossiles n'étaient pas encore considérés comme les restes ou les traces d'êtres vivants d'époques révolues. Ils suscitaient toutefois de l'intérêt lorsqu'ils ressemblaient à des animaux ou à des plantes. Après la mort de Gessner, une partie de sa collection est revenue au médecin municipal de Bâle, Felix Platter.