Marc Zehntner est né à Bâle en 1972. Il a étudié l'économie d'entreprise à Bâle et a suivi une formation complémentaire en collecte de fonds à l'Université de Fribourg (CH). Il a de nombreuses années d'expérience à des postes de direction dans le domaine de la culture et de la gestion des musées et a été chargé de cours, par exemple sur le marketing pour les institutions culturelles, à la Haute école spécialisée de la Suisse du Nord–Ouest. Il a pris son premier poste de direction en 2000. Il a été entre autres pendant cinq ans responsable administratif et opérationnel du Musée d'histoire naturelle de Bâle et membre de la direction. Plus récemment, il a été co-directeur pendant plus de dix ans du Vitra Design Museum, musée de renommée internationale à Weil am Rhein. Marc Zehntner est marié et père de trois enfants.