Le chœur réaménagé de l’ancienne église franciscaine présente des témoignages impressionnants du Moyen Age. Les œuvres provenant de Bâle, de la région du Rhin supérieur, de Suisse ou du sud de l’Allemagne révèlent le monde des croyances de l’époque et le rôle dominant de l’Eglise dans la vie quotidienne. Des objets remarquables illustrent l’évolution dans les formes et le changement des fonctions. Ils permettent un regard sur l’aménagement et l’iconographie des églises du Moyen Age, sur les usages liturgiques et les représentations religieuses. Des motifs importants de l’art médiéval, comme le crucifix ou les représentations de Marie sont des thèmes évoquant l’amour, la souffrance et l’espérance, mais aussi la gloire et la misère d’une époque depuis longtemps révolue. L’exposition étudie ainsi les valeurs chrétiennes et leurs rapports de plus en plus lointains à notre société de moins en moins confessionnelle.
Le plus grand objet de l'exposition, le retable monumental de Santa Maria à Calanca (canton des Grisons) date de 1512. Deux films produits par le bureau Berrel Gschwind sur commande du Musée historique de Bâle le présentent sous un nouveau jour.